1909年，著名的伊藤博文暗杀事件由于神秘人物井上源的出现被阻止，紧接着人类的历史被改写，到2009年，整个东亚地区均成为日本帝国的领土，汉城更成为日本第三个极其重要的城市。 韩裔“日本人” 板本正行是日本调查局一名忠心耿耿的特务，他的好友兼搭档是西乡将二郎，而他的强劲对手是名叫“朝鲜自由”的地下抗日组织。“朝鲜自由”制造了对井上美术博物馆的恐怖袭击，板本正行受命调查时，一块来自石器时代的出土于中国哈尔滨的石头“月灵”令他于无意间发现日本帝国隐藏了整整一百年的大阴谋，重新选择了人生道路，更与西乡将二郎由朋友变成敌人。