「COLD BODY WARM HEART」 仮想空間の進歩により、人間の意識の入れ物が肉体である必要がなくなり、人類の活動範囲も電子空間と宇宙空間のはるかかなたまで広げていた時代。 しかしその一方で、無人帝国「アトランティス」が、人類の新たな活動空間に対し侵攻を企てていた。 ヒカリは、ある時は母親のマリの意識が融合した高機能宇宙船を駆り、またある時は電子空間に意識を遊ばせる少女。ある日、アトランティスのWeb空間を散策中に、 自身も初めてみる謎のノイズを見つける。これが人間の意識であると解読したヒカリたちは、アトランティスの追手を逃れながら、完全な解凍を行うため惑星コンピュータ「ニコラテスタ」に向かう。 「ニコラテスタ」にて解凍に成功、研究者で技師のロミオを味方につけるも、アトランティスの執拗な追跡を受ける。